目前，在脱硫系统中使用的液下泵结构有两种，即无轴封结构和带有轴封结构（机械密封）。
无轴封机构
叶轮轮毂与后护板之间无任何轴封，留有较大的间隙。此类结构多用在普通渣浆液下泵上，且浆液池深度大多≤2.5m，在脱硫系统中的液下泵中应用较少。此类结构在脱硫系统长轴液下泵中应用时，主要存在两个问题。一是泵运转时由于叶轮悬臂较长，在离心力的作用下，挠度大，会引起泵振动，甚至无法运行；二是由于没有轴封，泵轴在腐蚀性介质中高速运转，对泵轴材质的耐腐蚀性要求较高。
脱硫系统长轴液下泵轴封多采用机械密封。
由于立式泵叶轮在液下高速旋转，会产生很大的径向力，泵轴运转时，在机械密封安装处产生的挠度较大，使密封面之间的受力不均匀，导致密封效果不好。因此需要在机械密封上面设置支撑，减小悬臂长度，多采用滚动轴承支撑。同时采用机械密封能够有效防止浆液与泵轴接触，轴材质选用普通材质即可，避免采用耐腐材料而增加成本。
